经查，中国民营科技促进会、中国系统科学研究会未按规定接受2021年度全国性社会团体年度检查，违反了《社会团体登记管理条例》第二十八条的规定，依据《社会团体登记管理条例》第三十条第一款第（三）项的规定，民政部决定对中国民营科技促进会、中国系统科学研究会作出警告的行政处罚。

同时，依据《社会组织信用信息管理办法》的有关规定，自行政处罚生效之日起，民政部将中国民营科技促进会、中国系统科学研究会列入社会组织活动异常名录。